Huyện Thới Lai gồm 12 xã: Định Môn, Đông Bình, Đông Thuận, Tân Thạnh, Thới Tân, Thới Thạnh, Trường Thắng, Trường Thành, Trường Xuân, Trường Xuân A, Trường Xuân B, Xuân Thắng và 1 thị trấn: Thới Lai.

Quy hoạch hướng tới mục tiêu xây dựng và phát triển huyện Thới Lai giàu về kinh tế, phát triển về văn hóa, xã hội, mạnh về an ninh quốc phòng và đảm bảo môi trường sinh thái. Cơ sở hạ tầng kỹ thuật, hạ tầng xã hội từng bước đáp ứng yêu cầu phát triển trong tình hình mới. Đẩy nhanh tái cơ cấu nông nghiệp theo hướng nâng cao giá trị gia tăng, phát triển bền vững gắn với xây dựng nông thôn mới. Tập trung phát triển các sản phẩm có lợi thế so sánh, khả năng cạnh tranh gắn với thị trường tiêu thụ. Theo đó, trong cơ cấu kinh tế đến năm 2020, tỷ trọng nông nghiệp chiếm 41-42%, công nghiệp 22-23% và dịch vụ 36-37%. Đến năm 2030, tỷ trọng khu vực công nghiệp và dịch vụ chiếm trên 70% cơ cấu kinh tế của huyện. Về phương án tăng trưởng, các sở ngành thành phố và huyện Thới Lai thống nhất chọn phương án tăng trưởng kinh tế của huyện ở mức trung bình. Với phương án này, huyện phát triển mạnh về nông nghiệp theo hướng sản xuất hàng hóa quy mô lớn, trong công nghiệp phấn đấu thu hút các dự án lớn và hình thành các khu, cụm công nghiệp quy mô lớn.